เมทิลอัลลิลไตรซัลไฟด์ใช้กันอย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมอาหารและรสชาติ เนื่องจากมีกลิ่นฉุนแรงคล้ายกระเทียมและหัวหอม เป็นส่วนประกอบสำคัญในการสร้างรสชาติแท้จริงสำหรับผลิตภัณฑ์อาหารต่างๆ เช่น ซอส เครื่องปรุง และอาหารแปรรูป ในอุตสาหกรรมน้ำหอม ใช้เพื่อเพิ่มความลึกและความซับซ้อนให้กับน้ำหอมและผลิตภัณฑ์ที่มีกลิ่นบางชนิด นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาถึงประโยชน์ต่อสุขภาพ โดยเฉพาะคุณสมบัติต้านอนุมูลอิสระ ต้านจุลินทรีย์ และต้านการอักเสบ ซึ่งอาจนำไปใช้ในอาหารเสริมหรือผลิตภัณฑ์สุขภาพจากธรรมชาติ ในทางเกษตร สามารถทำหน้าที่เป็นยาฆ่าแมลงหรือสารไล่แมลงจากธรรมชาติ ช่วยปกป้องพืชผลจากศัตรูพืช การประยุกต์ใช้ที่หลากหลายทำให้เป็นสารประกอบที่มีคุณค่าข้ามอุตสาหกรรมหลายแห่ง