ตัวแทนคัดเลือกเป็นสารประกอบที่ใช้ในชีววิทยาโมเลกุลเพื่อระบุและรักษาเซลล์ สิ่งมีชีวิต หรือจุลินทรีย์ที่ถูกดัดแปลงพันธุกรรม โดยให้ความต้านทานต่อสิ่งที่ไม่ถูกดัดแปลงในสภาพการเพาะเลี้ยงหรือการทดลอง