Bistrifluoroacetamide ใช้หลักๆ เป็นสาร derivatizing ในเคมีวิเคราะห์ โดยเฉพาะในก๊าซโครมาโทกราฟี (GC) และสเปกโทรเมตรีมวล (MS) มันทำปฏิกิริยากับสารที่มีอะตอมไฮโดรเจน active เช่น แอลกอฮอล์, ฟีนอล, และเอมีน เพื่อสร้างอนุพันธ์ที่ระเหยง่ายซึ่งวิเคราะห์ได้ง่ายกว่า สิ่งนี้ช่วยเพิ่มการตรวจจับและการวัดปริมาณสารเหล่านี้ในส่วนผสมที่ซับซ้อน นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิเคราะห์กรดอะมิโน, สเตียรอยด์, และโมเลกุลที่เกี่ยวข้องทางชีวภาพอื่นๆ โดยปรับปรุงความเสถียรทางความร้อนและพฤติกรรมการโครมาโทกราฟี นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์สารอินทรีย์เฉพาะทางและในงานวิจัยที่ต้องการการปรับเปลี่ยนเคมีอย่างแม่นยำ