ไตรฟีนิลมีเทนธิออลใช้เป็นสารกลางเฉพาะทางในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการนำกลุ่มไตรติลธิโอล (TrS-) มาใช้เป็นสารป้องกันสำหรับกลุ่มธิออล สร้าง thioether ที่เสถียรเพื่อช่วยในการป้องกันและถอนการป้องกันอย่างเลือกสรรในขั้นตอนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน มีบทบาทสำคัญในการพัฒนายา พริเทน ไนคลีโอไซด์ และเคมีภัณฑ์ละเอียดที่ต้องการการควบคุมฟังก์ชันธิออลอย่างแม่นยำ นอกจากนี้ กลุ่มธิออลของมันยังช่วยให้ใช้เป็นสารถ่ายโอนโซ่ในปฏิกิริยาระดับและโพลิเมอร์ไรเซชัน ยังทำหน้าที่เป็นโครงสร้างพื้นฐานสำหรับสารประกอบที่มีกำมะถัน รวมถึงที่ใช้ในสีย้อม สีเม็ด และวิทยาศาสตร์วัสดุ และสามารถทำหน้าที่เป็นนิวคลีโอไฟล์ในการดักจับคาร์บอคาเทชันในวิธีการสังเคราะห์