โปรตีน Mouse WNT9A ที่ไม่มีแท็กใช้ในงานวิจัยทางชีววิทยาโดยเฉพาะในการศึกษาสัญญาณทางชีวภาพที่เกี่ยวข้องกับการพัฒนาของเซลล์และเนื้อเยื่อ โดยเฉพาะในกระบวนการสร้างเนื้อเยื่อระหว่างข้อ (interdigital tissue) และการพัฒนาระบบกระดูกและข้อต่อ โปรตีนนี้มีบทบาทสำคัญในเส้นทางสัญญาณ Wnt ซึ่องมีส่วนเกี่ยวข้องกับการควบคุมการแบ่งตัวของเซลล์ การแยกตัวของเซลล์ต้นกำเนิด และการพัฒนาของอวัยวะในระยะตัวอ่อน ในงานวิจัย โปรตีน Mouse WNT9A ที่ไม่มีแท็กถูกใช้เพื่อหลีกเลี่ยงผลกระทบจากโปรตีนแท็กที่อาจรบกวนการทำงานของโปรตีนเป้าหมาย ทำให้ผลการทดลองมีความแม่นยำและใกล้เคียงกับสภาวะจริงมากขึ้น นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาการโต้ตอบระหว่างโปรตีนกับตัวรับบนผิวเซลล์ เช่น Frizzled และ LRP5/6 เพื่อทำความเข้าใจถึงกลไกของสัญญาณ Wnt ที่ละเอียดมากยิ่งขึ้น โปรตีนนี้ยังมีศักยภาพในการประยุกต์ใช้ในงานวิจัยด้านการแพทย์ เช่น การซ่อมแซมเนื้อเยื่อ การรักษาภาวะกระดูกพรุน หรือโรคข้ออักเสบ โดยการกระตุ้นเส้นทางสัญญาณที่ช่วยส่งเสริมการสร้างกระดูกและการรักษาเนื้อเยื่ออย่างเป็นธรรมชาติ