ใช้ในสังเคราะห์สารประกอบออร์แกนิก โดยเฉพาะในการผลิตสารตั้งต้นสำหรับยาหรือสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากหมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์สามารถทำปฏิกิริยากับอะมีนหรือแอลกอฮอล์ได้ จึงเหมาะสำหรับการสร้างพันธะใหม่ในโมเลกุล เช่น การเตรียมซัลโฟนามายด์หรือซัลเฟตเอสเทอร์ ที่มีความสำคัญในอุตสาหกรรมยาและสารเคมีเฉพาะทาง นอกจากนี้ หมู่ไตรฟลูออร์เมทิลช่วยเพิ่มความเสถียรและฤทธิ์ทางชีวภาพของสารที่สังเคราะห์ได้