สารนี้ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์โอลิโกนิวคลีโอไทด์ โดยช่วยให้สามารถนำ 5-ไอโอโดยูริดีนเข้าไปในสายดีเอ็นเอได้อย่างจำเพาะเจาะจง หมู่ไอโอดีนทำหน้าที่เป็นจุดยึดสำหรับการปรับแต่งเพิ่มเติม เช่น การจับคู่ผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปลิงที่เร่งด้วยพัลลาเดียม ซึ่งช่วยให้สามารถติดฉลาก โพรบ หรือหมู่อื่นๆ ได้ กลุ่มปกป้อง DMT และ CE phosphoramidite ทำให้เข้ากันได้กับโปรโตคอลการสังเคราะห์แบบ solid-phase มาตรฐาน จึงเหมาะสำหรับเครื่องสังเคราะห์ดีเอ็นเออัตโนมัติ สารนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาโอลิโกนิวคลีโอไทด์แอนติเซนส์ที่ปรับแต่งแล้ว โพรบวินิจฉัย และยารักษาที่ใช้กรดนิวคลีอิก ซึ่งต้องการการปรับแต่งอย่างแม่นยำ นอกจากนี้ อะตอมไอโอดีนยังช่วยอำนวยความสะดวกในการศึกษากายวิภาคด้วยเทคนิคเช่น X-ray crystallography หรือใช้เป็น radiosensitizer ในการวิจัยโฟโตไดนามิกเทอราพี