MC 1046 ถูกนำมาใช้เป็นหลักในสาขาการวิจัยมะเร็ง โดยทำหน้าที่เป็นตัวยับยั้ง topoisomerase II ที่มีประสิทธิภาพ ซึ่งเป็นเอนไซม์ที่สำคัญสำหรับการจำลอง DNA และการแบ่งเซลล์ โดยการกำหนดเป้าหมายเอนไซม์นี้ MC 1046 ขัดขวางการเพิ่มจำนวนของเซลล์มะเร็งอย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการศึกษากลไกของเคมีบำบัด การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการศึกษาก่อนคลินิก ซึ่งใช้ในการประเมินประสิทธิภาพของการบำบัดมะเร็งใหม่และเพื่อทำความเข้าใจกลไกการดื้อยาในมะเร็งประเภทต่างๆ นอกจากนี้ MC 1046 ยังถูกใช้ในงานทดลองชีวเคมีเพื่อตรวจสอบบทบาทของ topoisomerase II ในกระบวนการซ่อมแซม DNA และความเสถียรของจีโนม ความสามารถในการเหนี่ยวนำความเสียหายของ DNA และการตายของเซลล์ (apoptosis) ในเซลล์มะเร็งยังทำให้เป็นผู้สมัครสำหรับการบำบัดแบบผสม ซึ่งเสริมฤทธิ์ของตัวแทนเคมีบำบัดอื่นๆ