2-Aminoethyl Methyl Sulfone Hydrochloride ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาต่างๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่มุ่งเป้าไปที่ความผิดปกติทางระบบประสาท ทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีศักยภาพในการรักษาผลกระทบทางบำบัดต่อระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโมเลกุลที่มีกลุ่มซัลโฟน ซึ่งมีคุณค่าในเคมียารักษาโรคเนื่องจากมีชีวกิจกรรมและความเสถียร โครงสร้างทางเคมีเฉพาะที่ทำให้มีบทบาทสำคัญในการวิจัยและพัฒนายาใหม่