สารกลางทางเภสัชกรรมที่มีกำมะถันเป็นสารประกอบอินทรีย์ที่มีอะตอมกำมะถัน ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบหลักในการสังเคราะห์ยาที่มีโครงสร้างบำบัดเฉพาะ โดยเฉพาะยาที่มุ่งเป้าไปที่ฟังก์ชันกำมะถัน