ใช้หลักๆ เป็นสารกลางที่ทำปฏิกิริยาได้สูงในงานสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมอนุพันธ์ซัลโฟนาไมด์และสารประกอบฟลูออรีน หมู่ฟลูออโรซัลโฟนิลของมันสามารถเข้าร่วมในปฏิกิริยาซัลโฟนีเลชันได้อย่างง่ายดาย ทำให้มีคุณค่าต่อการวิจัยในเภสัชกรรมและเกษตรเคมีสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาวัสดุใหม่และสารประกอบอะโรมาติกที่ถูกฟังก์ชันนาไลซ์ ซึ่งต้องการการนำหมู่ซัลโฟนิลฟลูออไรด์เข้าไป เนื่องจากความทำปฏิกิริยาสูงของมัน จึงช่วยให้การดริฟาไทเซชันที่มีประสิทธิภาพในเคมีทางการแพทย์ รวมถึงการติดฉลากและการไบโอคอนจูเกชัน