ใช้เป็นสารตัวทำปฏิกิริยาซัลโฟนิลเลชันที่มีปฏิกิริยาสูงในสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการเตรียมซัลโฟนาไมด์และเอสเทอร์ซัลโฟเนต กลุ่ม trifluoromethyl ที่ดูดอิเล็กตรอนช่วยเพิ่มความสามารถในการเป็น electrophile ทำให้มีประสิทธิภาพในการปรับเปลี่ยนเปปไทด์และการติดฉลากโปรตีน ใช้กันทั่วไปในชีวเคมีสำหรับการยับยั้งแบบโคเวเลนต์ของเซรีนไฮโดรเลสและกลุ่มเอนไซม์อื่นๆ เนื่องจากสามารถทำปฏิกิริยาเลือกสรรกับสารตกค้างในตำแหน่งออกฤทธิ์ นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาโพรบโคเวเลนต์และยาที่ต้องการการจับแบบคงที่และไม่อาจย้อนกลับได้ ลักษณะความคงตัวและปฏิกิริยาทำให้เหมาะสำหรับใช้ในระบบตัวทำละลายทั้งน้ำและอินทรีย์