ใช้หลักๆ เป็นตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารเกษตรเคมีและเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาฆ่าหญ้าและยาฆ่าเชื้อรา หมู่ซัลโฟนิลคลอไรด์ทำปฏิกิริยากับเอมีนและแอลกอฮอล์ได้ง่าย ทำให้มีคุณค่าในการสร้างอนุพันธ์ซัลโฟนาไมด์และเอสเตอร์ซัลโฟเนต นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโมเลกุลชีวภาพที่อิงจากซัลโฟนาไมด์ รวมถึงตัวยับยั้งคินาสและตัวยารักษาโรคอื่นๆ เนื่องจากหมู่แทนที่ trifluoromethyl และ bromo ที่ดึงอิเล็กตรอน ทำให้เพิ่มปฏิกิริยาในปฏิกิริยาครอสคัปปลิ้ง สนับสนุนการใช้ในสังเคราะห์ออร์แกนิกขั้นสูงและการค้นพบยา