เอทิล อีเทนซัลโฟเนตใช้หลักๆ ในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารอัลคิลเลติ้งเอเจนต์ (alkylating agent) โดยถูกนำมาใช้เพื่อนำกลุ่มเอทิลเข้าไปในสารประกอบอินทรีย์ต่างๆ ซึ่งมีความสำคัญในการผลิตยา สารเคมีทางการเกษตร และสารเคมีพิเศษอื่นๆ ในการวิจัย มันทำหน้าที่เป็นรีเอเจนต์สำหรับการปรับเปลี่ยน DNA และโปรตีน ช่วยในการศึกษาการโต้ตอบโมเลกุลและกลไกต่างๆ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนาวัสดุใหม่ๆ ซึ่งต้องการการอัลคิลเลชันที่แม่นยำเพื่อให้ได้คุณสมบัติที่ต้องการ บทบาทของมันในแอปพลิเคชันเหล่านี้ยืนยันถึงความสำคัญในการส่งเสริมทั้งอุตสาหกรรมและการวิจัยทางวิทยาศาสตร์ อย่างไรก็ตาม เนื่องจากเป็นสารที่มีความเป็นพิษ จึงต้องมีการจัดการอย่างระมัดระวังและปฏิบัติตามมาตรฐานความปลอดภัยอย่างเคร่งครัด