ใช้หลักๆ เป็นสารเชื่อมต่อในกระบวนการไบโอคอนจูเกชัน สารประกอบนี้ช่วยให้สามารถติดแท็กหรือโปรบที่มีฟลูออรีนสูงกับไบโอโมเลกุล เช่น โปรตีน เพปไทด์ และแอนติบอดี ได้อย่างมั่นคง หมู่เอสเตอร์ N-hydroxysuccinimide (NHS) ทำปฏิกิริยากับอะมีนปฐมภูมิภายใต้สภาวะอ่อนโยนอย่างมีประสิทธิภาพ สร้างพันธะอะไมด์ที่มั่นคง โซ่เพอร์ฟลูออรีนยาวให้ความไฮโดรโฟบิกและความคงตัวทางเคมีที่ยอดเยี่ยม ทำให้เหมาะสำหรับการใช้งานในภาพถ่าย MRI ฟลูออรีน-19 (19F MRI) โดยทำหน้าที่เป็นเทรเซอร์ที่ไวต่อสัญญาณเนื่องจากสัญญาณ 19F NMR ที่แรง นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาพื้นผิวฟลูออรีนสำหรับเซ็นเซอร์ชีวภาพและการทดสอบวินิจฉัย ซึ่งต้องการการรบกวนพื้นหลังต่ำและความไวในการตรวจจับสูง ลักษณะไลโปโฟบิกและไฮโดรโฟบิกที่เป็นเอกลักษณ์ยังถูกนำมาใช้ในการสร้างสารเคลือบที่ไม่ติดสิ่งสกปรกและในการศึกษาการโต้ตอบโมเลกุลในสภาพแวดล้อมชีวภาพที่ซับซ้อน