2-Chlorotrityl Chloride Resin ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) ในฐานะวัสดุรองรับที่หลากหลาย การประยุกต์ใช้หลักคือการยึดอะมิโนกรดตัวแรกเข้ากับเรซิน ซึ่งให้พันธะที่เสถียรในขณะที่อนุญาตให้มีการตัดขาดภายใต้สภาวะอ่อนโยนในขั้นตอนการกำจัดสารป้องกันสุดท้าย เรซินนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งสำหรับความสามารถในการอำนวยความสะดวกในการสังเคราะห์กรดเปปไทด์ เนื่องจากช่วยให้ปล่อยเปปไทด์โดยไม่จำเป็นต้องใช้กรดที่รุนแรง จึงลดปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ นอกจากนี้ยังเหมาะสำหรับการสังเคราะห์ชิ้นส่วนเปปไทด์ที่ป้องกันบางส่วน ซึ่งมักใช้ในกลยุทธ์การสังเคราะห์เปปไทด์แบบรวม ความเข้ากันได้ของเรซินกับตัวทำละลายและสารเคมีหลากหลายทำให้เป็นตัวเลือกยอดนิยมทั้งในงานวิจัยและอุตสาหกรรมสำหรับการผลิตเปปไทด์ความบริสุทธิ์สูง