เบนซามิล ไฮโดรคลอไรด์ถูกใช้อย่างแพร่หลายในทางการแพทย์เพื่อศึกษากลไกการทำงานของช่องโซเดียม (ENaC) ในเซลล์ โดยเฉพาะในบริเวณไตและระบบทางเดินหายใจ มันเป็นสารยับยั้งที่เลือกปฏิบัติต่อช่องโซเดียมเหล่านี้ ทำให้มีบทบาทสำคัญในการวิจัยเกี่ยวกับโรคที่เกี่ยวข้องกับการดูดซึมโซเดียมผิดปกติ เช่น โรคซิสติก ไฟโบรซิส นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาเบื้องต้นเกี่ยวกับการนำไปใช้เพื่อลดอาการบวมน้ำในสมอง และการรักษาภาวะความดันโลหิตสูงในบางกรณี อย่างไรก็ตาม การใช้ในมนุษย์ยังอยู่ในขั้นตอนการวิจัยและพัฒนา