แอมโมเนียมไทโอซัลเฟตใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการถ่ายภาพในฐานะสารยึดภาพ (fixing agent) ซึ่งช่วยกำจัดเงินฮาไลด์ที่ไม่ได้รับแสงออกจากฟิล์มและกระดาษถ่ายภาพ ทำให้ภาพคงทนและชัดเจน

ในด้านเกษตรกรรม ทำหน้าที่เป็นปุ๋ยที่มีประสิทธิภาพสูง โดยเฉพาะสำหรับพืชที่ต้องการกำมะถันและไนโตรเจนที่พร้อมใช้งาน มักนำไปใช้ผ่านระบบชลประทานหรือพ่นทางใบ เพื่อส่งเสริมการเจริญเติบโตของพืชและเพิ่มผลผลิต

นอกจากนี้ ยังใช้ในอุตสาหกรรมเหมืองแร่และโลหะวิทยาในการสกัดโลหะมีค่าอย่างทองคำและเงิน โดยทำหน้าที่เป็นสารละลาย (leaching agent) ที่ละลายโลหะเหล่านี้ออกจากแร่ในลักษณะที่เป็นมิตรต่อสิ่งแวดล้อมมากกว่าวิธีแบบไซยาไนด์ดั้งเดิม

ในการบำบัดน้ำ แอมโมเนียมไทโอซัลเฟตใช้เพื่อทำให้คลอรีนเป็นกลางในน้ำเสีย ทำให้ปลอดภัยสำหรับการปล่อยสู่สิ่งแวดล้อม นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการทำความสะอาดอุตสาหกรรมบางอย่างเพื่อขจัดคราบดำและการกัดกร่อนจากพื้นผิวโลหะ