โปรตีนนี้ถูกใช้เป็นตัวอย่างสำคัญในการศึกษาเกี่ยวกับระบบภูมิคุ้มกัน โดยเฉพาะบทบาทของ CD39 ในการควบคุมการอักเสบและการทำงานของเซลล์ภูมิคุ้มกัน โปรตีนที่มี His Tag ทำให้สามารถทำ purification ได้ง่าย จึงเหมาะสำหรับการใช้ในงานวิจัยด้านชีววิทยาโมเลกุลและการพัฒนายา มักใช้ใน ELISA, Western blot หรือการศึกษาการจับกับลิแกนด์หรือโปรตีนอื่นๆ เพื่อทำความเข้าใจเส้นทางสัญญาณที่เกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลง ATP เป็น ADP และ AMP ซึ่งมีผลต่อสภาพแวดล้อมที่มีการอักเสบ เช่น ในมะเร็ง โรคภูมิคุ้มกันผิดปกติ หรือโรคเรื้อรัง นอกจากนี้ยังใช้เป็นมาตรฐานหรือตัวควบคุมในห้องปฏิบัติการเพื่อพัฒนาการตรวจวัดระดับ CD39 ในตัวอย่างชีวภาพ และสามารถนำไปใช้สนับสนุนการพัฒนาแอนติบอดีหรือสารยับยั้งที่มีศักยภาพสำหรับการรักษาโรคต่างๆ