4-Ethynylpyridin-3-amine ใช้หลักๆ ในการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยเภสัชกรรม ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนาสารชีวภาพต่างๆ โดยเฉพาะในการสร้างโมเลกุลที่มีศักยภาพในการรักษาโรค กลุ่มเอทไทนิลของมันช่วยให้สามารถดัดแปลงทางเคมีได้หลากหลาย ทำให้มีคุณค่าต่อปฏิกิริยาเคมีคลิก ซึ่งถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการค้นพบยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิก ซึ่งมักถูกสำรวจสำหรับคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์ ต้านมะเร็ง และต้านการอักเสบ โครงสร้างไพรีดินของมันยังเพิ่มประโยชน์ในการออกแบบลิแกนด์สำหรับการประสานกับโลหะและการเร่งปฏิกิริยา