Methyl 2-amino-6-bromonicotinate ใช้หลัก ๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างของมันทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลซับซ้อน โดยเฉพาะการสังเคราะห์สารประกอบเฮเตอโรไซคลิก มักใช้ในการผลิตส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) สำหรับยาที่เล็งเป้าไปยังด้านการรักษาต่าง ๆ รวมถึงยาต้านการอักเสบ ต้านไวรัส และต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง สนับสนุนการพัฒนาโซลูชันป้องกันพืช กลุ่มโบรมีนและเอสเทอร์ช่วยให้สามารถปรับเปลี่ยนทางเคมีได้หลากหลาย ทำให้เป็นส่วนประกอบสำคัญในงานวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม