ใช้เป็นสารตัวกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งคินาสและสารประกอบชีวภาพอื่นๆ หมู่ฮาโลเจนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามแบบเลือกสรรได้ เช่น ปฏิกิริยาซูซูกิหรือการอะมินีชันแบบบูชวัลด์-ฮาร์ทวิก ซึ่งช่วยในการสร้างโครงสร้างพิริดีนที่ซับซ้อน นิยมใช้ในเคมียารักษาเพื่อการปรับปรุงสารนำ (lead optimization) เนื่องจากสามารถปรับแต่งคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และ steric ได้ละเอียด นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโพรบเรืองแสงและวัสดุฟังก์ชันนัลที่พิริดีนที่มีฮาโลเจนเป็นหน่วยย่อย