เมทิล 5-ไฮดรอกซี-6-ไอโอโดพิโคลิเนต ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารกลางที่หลากหลายสำหรับการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะมีคุณค่าต่อการพัฒนายา ที่ซึ่งทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) โครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มไฮดรอกซิลและไอโอดีน ทำให้มีประโยชน์ในการทำปฏิกิริยาครอสคัปเปลิง เช่น Suzuki หรือ Sonogashira couplings ซึ่งจำเป็นสำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนในการค้นพบยา นอกจากนี้ยังมีการประยุกต์ใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร ที่ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาสารประกอบที่มีคุณสมบัติกำจัดศัตรูพืชหรือวัชพืช บทบาทในวิทยาศาสตร์วัสดุก็เด่นชัดเช่นกัน เนื่องจากสามารถนำไปใช้ในการเตรียมวัสดุอินทรีย์ขั้นสูงที่มีคุณสมบัติอิเล็กทรอนิกส์หรือเลนส์เฉพาะ