2-Amino-5-phenylpyrazine ใช้หลัก ๆ ในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนาสารประกอบชีวภาพหลากหลาย โดยเฉพาะในการสังเคราะห์โมเลกุลเฮเตอร์โรไซคลิก โมเลกุลเหล่านี้มักถูกสำรวจเพื่อการประยุกต์ใช้ทางรักษาที่มีศักยภาพ รวมถึงคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์ ต้านมะเร็ง และต้านการอักเสบ นอกจากนี้ โครงสร้างของมันทำให้เป็นหน่วยก่อสร้างที่มีคุณค่าในการออกแบบลิแกนด์สำหรับเคมีการประสานของโลหะ ซึ่งมีประโยชน์ในการเร่งปฏิกิริยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ สารประกอบนี้ยังถูกศึกษาในบริบทของการค้นพบยาเพื่อศักยภาพในการปรับเปลี่ยนเป้าหมายทางชีวภาพและเส้นทาง