สารเคมีนี้มีการใช้งานหลักในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในการสร้างเปปไทด์ที่มีความซับซ้อนและมีความจำเพาะสูง มักใช้ในขั้นตอนของการป้องกันกลุ่มฟังก์ชัน (protection group) และการเชื่อมต่อกรดอะมิโน (amino acid coupling) ในเทคนิค solid-phase peptide synthesis (SPPS) โดย Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับกลุ่มเอมีน ในขณะที่ tBu (tert-butyl) และ Psi(Me,Me)pro ทำหน้าที่ป้องกันกลุ่มไฮดรอกซิลและกลุ่มอื่นๆ ที่อาจเกิดปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ระหว่างการสังเคราะห์ สารนี้ช่วยให้สามารถควบคุมและปรับแต่งลำดับกรดอะมิโนได้อย่างแม่นยำ ซึ่งเป็นสิ่งสำคัญในการผลิตเปปไทด์สำหรับการวิจัยทางชีววิทยาและการพัฒนายา