N-(1-Naphthalenesulfonyl)-L-phenylalanine ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยทางชีวเคมีเป็นสารตั้งต้นหรือตัวยับยั้งในงานศึกษากลไกเอนไซม์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีคุณค่าต่อการตรวจสอบกิจกรรมและความจำเพาะของโปรติเอส เนื่องจากโครงสร้างของมันช่วยให้สามารถโต้ตอบกับจุดออกฤทธิ์ของเอนไซม์ได้ สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการพัฒนาตัวยับยั้งเอนไซม์เพื่อวัตถุประสงค์ทางรักษา ซึ่งช่วยในการศึกษาโรคที่กิจกรรมของโปรติเอสผิดปกติ นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสังเคราะห์อินทรีย์เพื่อสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้นที่มีศักยภาพทางเภสัชวิทยา โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันทำให้เป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์ในการทำความเข้าใจปฏิกิริยาระหว่างโปรตีนกับลิแกนด์และการออกแบบยาที่เจาะจง