FMOC-NVA-OH ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นกลุ่มปกป้องสำหรับกรดอะมิโน กลุ่ม FMOC ช่วยปกป้องกลุ่มอะมิโนระหว่างกระบวนการจับคู่ เพื่อให้เกิดปฏิกิริยาที่เลือกสรรและป้องกันผลิตภัณฑ์ข้างเคียงที่ไม่พึงประสงค์ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) ซึ่งช่วยให้สามารถประกอบเปปไทด์แบบทีละขั้นตอนด้วยประสิทธิภาพและความแม่นยำสูง หลังจากได้ลำดับเปปไทด์ที่ต้องการแล้ว กลุ่ม FMOC สามารถถูกกำจัดออกได้อย่างง่ายดายภายใต้สภาวะเบสอ่อน ๆ โดยทั่วไปใช้ piperidine โดยไม่กระทบต่อโครงสร้างหลักของเปปไทด์ ทำให้ FMOC-NVA-OH เป็นสารเคมีที่สำคัญในการผลิตเปปไทด์สำหรับการวิจัยเภสัชกรรม การพัฒนายา และการศึกษาทางชีวเคมี