สารเคมีนี้เป็นหน่วยสร้างเฉพาะทางในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะ N-Boc-O-(N-Fmoc-L-alanyl)-L-serine กลุ่ม Boc (tert-butyloxycarbonyl) ปกป้องหมู่แอมีนอัลฟาของเซรีน ในขณะที่หมู่ไฮดรอกซิลของสายข้างเซรีนถูกปกป้องผ่านพันธะเอสเตอร์กับอะลานีนที่ปกป้องด้วย Fmoc กลยุทธ์การปกป้องแบบคู่นี้ ซึ่งรวมอะลานีนที่ปกป้องด้วย Fmoc บนสายข้างของเซรีน ช่วยให้สามารถถอดการปกป้องแบบเลือกเพศและใช้ระบบปกป้องแบบออร์โธกอนัลได้ในระหว่างการประกอบเปปไทด์ทีละขั้นตอน สารนี้มีความสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (Solid-phase peptide synthesis, SPPS) สำหรับการสร้างเปปไทด์ซับซ้อนด้วยการควบคุมลำดับที่แม่นยำและความบริสุทธิ์สูง การประยุกต์ใช้รวมถึงงานวิจัยเภสัชวิทยา เทคโนโลยีชีวภาพ และการพัฒนาเปปไทด์บำบัดและเปปไทด์เลียนแบบ