H-Ala-oall Hydrochloride ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นหน่วยย่อยสำหรับสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อน โดยทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน เพื่อให้แน่ใจว่าการตอบสนองเฉพาะเกิดขึ้นที่ตำแหน่งที่ต้องการโดยปราศจากการตอบสนองข้างที่ไม่พึงประสงค์ สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตาย (SPPS) ซึ่งช่วยในการประกอบเปปไทด์แบบขั้นตอน การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การพัฒนายา รวมถึงยาที่มีฐานเป็นเปปไทด์ ซึ่งการควบคุมการรวมกรดอะมิโนอย่างแม่นยำเป็นสิ่งสำคัญ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในงานวิจัยเพื่อศึกษาการโต้ตอบ การพับตัว และหน้าที่ของเปปไทด์ สนับสนุนความก้าวหน้าในด้านชีวเคมีและการค้นพบยา