สารเคมีนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ซับซ้อน โดยเฉพาะในเคมีเปปไทด์และโปรตีน ทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการเตรียมอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ป้องกันไว้ ซึ่งจำเป็นสำหรับการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตะกอน (SPPS) กลุ่มป้องกัน Boc (tert-butoxycarbonyl) ในโครงสร้างมีบทบาทสำคัญในการปกป้องกลุ่มฟังก์ชันเอมีนระหว่างกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน เพื่อให้เกิดปฏิกิริยาแบบเลือกสรรและป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ นอกจากนี้ ยังนำไปใช้ในการพัฒนายาและสารชีวภาพออกฤทธิ์ ซึ่งต้องควบคุมโครงสร้างโมเลกุลอย่างแม่นยำ การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การวิจัยเคมียารักษา ช่วยสร้างยาใหม่และสารรักษา