สารเคมีนี้ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน มันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตาย (solid-phase peptide synthesis: SPPS) เนื่องจากมีกลุ่มป้องกัน fluorenylmethoxycarbonyl (Fmoc) ซึ่งสามารถถูกกำจัดออกภายใต้สภาวะเบสโดยไม่กระทบต่อกลุ่มฟังก์ชันที่อ่อนไหวอื่นๆ

การรวมโมเลกุล 2,4-difluorophenyl เข้าไปช่วยเพิ่มประโยชน์ของสารนี้ในการออกแบบเปปไทด์ที่มีคุณสมบัติการจับเฉพาะหรือกิจกรรมทางชีวภาพ โดยมักมุ่งเป้าไปที่เอนไซม์หรือตัวรับที่ซึ่งการแทนที่ด้วยฟลูออรีนสามารถปรับปรุงความเสถียรและการโต้ตอบ

นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการพัฒนายาและเปปไทด์ชีวกิจกรรม โดยเฉพาะในการวิจัยที่มุ่งสร้างสารที่มีคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์ ต้านไวรัส หรือต้านมะเร็ง บทบาทของมันในการปรับเปลี่ยนเปปไทด์และการค้นพบยาทำให้เป็น reagent สำคัญในเคมียารักษาและชีวเคมี

ในทางอุตสาหกรรม สารนี้ยังถูกใช้เป็นสารตั้งต้นสำหรับการสังเคราะห์สารเคมีอื่นๆ ที่มีความซับซ้อนและมีมูลค่าสูง ซึ่งเป็นส่วนสำคัญในกระบวนการผลิตยาชนิดต่างๆ