Fmoc-HoCys(Trt)-OH เป็นสารเคมีที่ใช้อย่างแพร่หลายในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในการใช้เป็นสารตั้งต้นในการสร้างสายเปปไทด์แบบ solid-phase peptide synthesis (SPPS) สารนี้มีกลุ่มป้องกัน Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ซึ่งช่วยในการควบคุมการสร้างพันธะเปปไทด์อย่างแม่นยำ และกลุ่ม Trt (Trityl) ที่ทำหน้าที่ป้องกันกลุ่มไทออลของโฮโมซิสเตอีน เพื่อป้องกันไม่ให้เกิดปฏิกิริยาข้างเคียงที่ไม่ต้องการในระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ กลุ่ม Fmoc สามารถกำจัดได้ภายใต้สภาวะเบส และกลุ่ม Trt สามารถตัดออกภายใต้สภาวะกรด ทำให้สามารถคัดเลือกการกำจัดกลุ่มป้องกันได้

นอกจากนี้ Fmoc-HoCys(Trt)-OH ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา เพื่อสังเคราะห์เปปไทด์ที่มีความซับซ้อนและมีคุณสมบัติเฉพาะ เช่น เปปไทด์ที่ใช้ในการพัฒนายาและวัคซีน เนื่องจากโฮโมซิสเตอีนเป็นกรดอะมิโนอนุพันธ์ที่มีความสำคัญในการสร้างพันธะไดซัลไฟด์หรือการปรับเปลี่ยนทางเคมีเฉพาะ ซึ่งมีบทบาทในการกำหนดโครงสร้างสามมิติและความเสถียรของโปรตีนและเปปไทด์

การใช้สารนี้ยังช่วยเพิ่มประสิทธิภาพและความแม่นยำในการสังเคราะห์เปปไทด์ ทำให้ได้ผลิตภัณฑ์ที่มีความบริสุทธิ์สูงและมีโครงสร้างที่ถูกต้องตามที่ต้องการ