Boc-His-OMe ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นรูปแบบที่ป้องกันของ histidine. กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ช่วยปกป้องกลุ่มอะมิโน ในขณะที่ OMe (methyl ester) ปกป้องกลุ่มคาร์บอกซิล ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกเฉพาะได้ในระหว่างการประกอบโซ่เปปไทด์. มีประโยชน์โดยเฉพาะในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) เพื่อควบคุมลำดับและโครงสร้างของเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ. สารประกอบนี้ยังใช้ในการพัฒนาเปปไทด์ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพและการวิจัยเภสัชกรรม ซึ่ง histidine มีบทบาทสำคัญในกิจกรรมเอนไซม์และการจับไอออนโลหะ. ความเสถียรและความง่ายในการถอดกลุ่มป้องกันทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าในเคมีอินทรีย์และเคมีการแพทย์.