สารประกอบนี้ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในรูปแบบที่ป้องกันของไลซีน กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ปกป้องกลุ่มอะมิโน ในขณะที่ OtBu (tert-butyl ester) ปกป้องกลุ่มคาร์บอกซิล ทำให้เกิดปฏิกิริยาที่เลือกเฉพาะระหว่างการประกอบโซ่เปปไทด์ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) และการสังเคราะห์แบบเฟสของเหลว ซึ่งขั้นตอนการถอดการป้องกันที่ควบคุมได้เป็นสิ่งจำเป็น การประยุกต์ใช้มีความสำคัญในการผลิตเปปไทด์สำหรับการวิจัยเภสัชกรรม การพัฒนายา และการศึกษาทางชีวเคมี ทำให้สามารถสร้างโครงสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อนด้วยความแม่นยำสูง นอกจากนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ที่ดัดแปลงและ peptidomimetics ซึ่งสำคัญในการออกแบบตัวแทนบำบัดที่กำหนดเป้าหมายไปยังเส้นทางชีวภาพเฉพาะ