Fmoc-2-chloro-L-homophenylalanine ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในกระบวนการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตาย (solid-phase peptide synthesis: SPPS) มันทำหน้าที่เป็นอนุพันธ์กรดอะมิโนที่ได้รับการป้องกัน โดยที่กลุ่ม Fmoc (fluorenylmethyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันชั่วคราวสำหรับกลุ่มเอมีน ซึ่งช่วยให้สามารถเพิ่มกรดอะมิโนตามลำดับเพื่อสร้างเปปไทด์ด้วยความแม่นยำสูง ตัวแทนคลอโรบนโซ่ข้างของ homophenylalanine สามารถนำมาใช้ประโยชน์สำหรับการดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติม ทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนายาเพปไทด์และโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้ การใช้งานของมันมีความสำคัญในการสร้างเปปไทด์ที่มีคุณสมบัติโครงสร้างหรือหน้าที่เฉพาะ เช่น ที่จำเป็นในเคมียารักษา การวิจัยทางชีวเคมี และการค้นพบยา นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์ peptidomimetics และโมเลกุลอินทรีย์ซับซ้อนอื่นๆ ที่ต้องการการควบคุมการรวมกรดอะมิโนอย่างแม่นยำ