Z-Hyp(Tbu)-OMe ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในรูปแบบที่ได้รับการป้องกันของไฮดรอกซีโพรลีน (hydroxyproline) โดยทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างเปปไทด์ที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและชีวเทคโนโลยี กลุ่มเทอร์ต-บิวทิล (Tbu) ปกป้องกลุ่มฟังก์ชันไฮดรอกซิลในระหว่างการสังเคราะห์ เพื่อป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่พึงประสงค์ ในขณะที่กลุ่มเมทิลเอสเตอร์ (OMe) ช่วยทำให้ปลายคาร์บอกซิลเสถียร สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายาเพปไทด์ โดยที่การควบคุมลำดับกรดอะมิโนอย่างแม่นยำเป็นสิ่งสำคัญ การประยุกต์ใช้ยังพบในงานวิจัยที่เกี่ยวข้องกับเปปไทด์คล้ายคอลลาเจน เนื่องจากไฮดรอกซีโพรลีนเป็นส่วนประกอบหลักในโครงสร้างคอลลาเจน การใช้ Z-Hyp(Tbu)-OMe ช่วยรับประกันความบริสุทธิ์สูงและประสิทธิภาพในการประกอบเปปไทด์ ทำให้เป็นสารเคมีสำคัญในเคมีสังเคราะห์ขั้นสูง