Z-D-Trp-OMe ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์เป็นหน่วยย่อยสำหรับสร้างโซ่เปปไทด์ที่ซับซ้อน โดยทำหน้าที่เป็นรูปแบบป้องกันของทริปโตเฟน เพื่อให้กรดอะมิโนคงตัวระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ สารประกอบนี้มีคุณค่ามากในงานวิจัยที่ต้องการลำดับเปปไทด์เฉพาะสำหรับศึกษาการโต้ตอบทางชีวภาพ หน้าที่ของเอนไซม์ หรือพัฒนายาและสารรักษา การใช้ช่วยให้ควบคุมโครงสร้างเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ ซึ่งสำคัญยิ่งในการค้นพบยาและการศึกษา biochemical นอกจากนี้ Z-D-Trp-OMe ยังใช้ในการพัฒนา peptidomimetics ซึ่งเป็นโมเลกุลที่ออกแบบมาเพื่อเลียนแบบโครงสร้างและหน้าที่ของเปปไทด์ธรรมชาติ โดยมักมีเสถียรภาพหรือกิจกรรมที่เพิ่มขึ้น