Z-Thr-OH ใช้หลักในการสังเคราะห์เปปไทด์ในรูปแบบที่ได้รับการป้องกันของ threonine กลุ่ม Z (benzyloxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับหมู่อะมิโน เพื่อป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่ต้องการระหว่างกระบวนการ coupling เปปไทด์ สารประกอบนี้มีประโยชน์โดยเฉพาะใน solid-phase peptide synthesis (SPPS) และ solution-phase synthesis ซึ่งการป้องกันและถอดป้องกันที่เลือกสรรของกรดอะมิโนเป็นสิ่งสำคัญ มันช่วยให้แน่ใจถึงลำดับและโครงสร้างที่ถูกต้องของสายเปปไทด์ ทำให้มีคุณค่าในการผลิตเปปไทด์บำบัด ฮอร์โมน และเปปไทด์สำหรับการวิจัย นอกจากนี้ Z-Thr-OH ยังถูกนำไปใช้ในการศึกษากลไกเอนไซม์และปฏิกิริยาโปรตีน เนื่องจากความเสถียรและความง่ายในการจัดการในห้องปฏิบัติการ