N-Acetylglycine ethyl ester ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับการเตรียมโมเลกุลที่ซับซ้อนมากขึ้น มันทำหน้าที่เป็นสารกลางในการผลิตเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์เปปไทด์และสารประกอบชีวภาพอื่นๆ กลุ่มเอสเตอร์ในโมเลกุลทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีประโยชน์ในการสร้างกรดอะมิโนที่ดัดแปลง ซึ่งจำเป็นในพัฒนายาและการวิจัยทางชีวเคมี นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเอนไซม์และเส้นทางเมแทบอลิซึม ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับพฤติกรรมของกรดอะมิโนที่ถูกอะซิติเลตในระบบชีวภาพ บทบาทของมันในการอำนวยความสะดวกในการก่อตัวพันธะเคมีเฉพาะทำให้มีคุณค่าในการออกแบบและสังเคราะห์ยาที่กำหนดเป้าหมาย