Boc-His(1-Me)-OH ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ในรูปแบบที่ได้รับการป้องกันของฮิสติดีน (histidine) การประยุกต์ใช้หลักคือในการเตรียมเปปไทด์ที่ฮิสติดีนจำเป็นต้องถูกนำเข้าไปอย่างเลือกสรรโดยไม่ถูกรบกวนจากปฏิกิริยาของสายข้าง กลุ่ม Boc (tert-butoxycarbonyl) ปกป้องกลุ่มอะมิโน ในขณะที่การดัดแปลง 1-methyl เสถียรภาพของวงแหวนอิมีดาโซล ทำให้เหมาะสมสำหรับการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็ง (SPPS) สารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์สำหรับการวิจัยทางชีวเคมี การพัฒนายา และการศึกษาการโต้ตอบของโปรตีน สิ่งนี้ช่วยรับประกันผลผลิตสูงและความบริสุทธิ์ในสายเปปไทด์ โดยเฉพาะในลำดับที่ซับซ้อนซึ่งฮิสติดีนมีบทบาทสำคัญ นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนายาแบบฐานเปปไทด์ รวมถึงเปปไทด์ต้านจุลินทรีย์และตัวยับยั้งเอนไซม์