Fmoc-Homophe-OH ใช้ในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะในกระบวนการ Solid-phase peptide synthesis (SPPS) ซึ่งเป็นเทคนิคที่นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อสร้างเปปไทด์ที่มีความยาวและความซับซ้อนต่าง ๆ เนื่องจากกลุ่ม Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ในโมเลกุลทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันที่สามารถกำจัดออกได้ง่ายโดยใช้เบส เช่น ไพเพอรีดีน ทำให้สามารถควบคุมการต่อเปปไทด์ได้อย่างแม่นยำ นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีของกรดอะมิโนและเปปไทด์ เพื่อพัฒนายาและสารชีวโมเลกุลใหม่ ๆ ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและชีวเทคโนโลยี