Fmoc-Tpi-OH ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์เปปไทด์ โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสตายตัว (Solid-phase peptide synthesis: SPPS) ซึ่งทำหน้าที่เป็นหน่วยสร้างหลักสำหรับการนำส่วนของ Tpi (Tetrahydroisoquinoline-3-carboxylic acid) เข้าสู่ลำดับเปปไทด์ สารประกอบนี้มีความสำคัญในการสร้างเปปไทด์ที่มีคุณสมบัติโครงสร้างและหน้าที่เฉพาะเจาะจง ซึ่งมักถูกนำไปใช้ในการพัฒนาเปปไทด์ชีวภาพและเปปไทด์เลียนแบบ (peptidomimetics) กลุ่มปกป้อง Fmoc (Fluorenylmethyloxycarbonyl) ช่วยให้เกิดการถอดกลุ่มปกป้องแบบเลือกสรรในการสังเคราะห์ ส่งผลให้สามารถควบคุมการประกอบโซ่เปปไทด์ที่ซับซ้อนได้อย่างแม่นยำ การประยุกต์ใช้ครอบคลุมถึงการค้นพบยา โดยช่วยในการออกแบบยารักษาที่มีพื้นฐานจากเปปไทด์ ตัวยับยั้งเอนไซม์ และลิแกนด์ของรีเซพเตอร์ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาการโต้ตอบของเปปไทด์ การพับตัว และความเสถียร ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาวิทยาศาสตร์ชีวเคมีและเคมีทางการแพทย์