โปรตีเนส เค รีโซลูชันถูกใช้อย่างแพร่หลายในงานวิจัยทางชีววิทยาโมเลกุล โดยเฉพาะในการสกัดและทำความสะอาด DNA และ RNA จากตัวอย่างทางชีววิทยา เช่น เนื้อเยื่อ เซลล์ หรือแบคทีเรีย เนื่องจากมีความสามารถในการย่อยสลายโปรตีนที่ปนเปื้อน ทำให้ได้กรดนิวคลีอิกที่บริสุทธิ์มากขึ้น นอกจากนี้ยังใช้ในกระบวนการทำลายโปรตีนที่อาจรบกวนการวิเคราะห์ในขั้นตอนต่อไป เช่น การทำ PCR หรือการวิเคราะห์ทางชีวเคมีอื่น ๆ โปรตีเนส เค ยังถูกนำไปใช้ในงานทางนิติวิทยาศาสตร์เพื่อช่วยในการสกัด DNA จากตัวอย่างที่ซับซ้อน เช่น ตัวอย่างที่เสื่อมสภาพหรือมีสิ่งปนเปื้อนสูง และในกระบวนการผลิตทางชีวภาพเพื่อย่อยสลายโปรตีนที่ไม่ต้องการ