Bestatin trifluoroacetate ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะตัวยับยั้งที่แรงของอะมิโนเปปติเดส โดยเฉพาะ leucine aminopeptidase มันถูกนำมาใช้เพื่อศึกษากลไกของเอนไซม์และเพื่อสำรวจบทบาทของอะมิโนเปปติเดสในกระบวนการทางชีวภาพต่าง ๆ รวมถึงการเมแทบอลิซึมของโปรตีนและการปรับเปลี่ยนการตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน ในด้านภูมิคุ้มกันวิทยา มันถูกใช้เพื่อตรวจสอบผลกระทบในการเสริมกิจกรรมของเซลล์ภูมิคุ้มกัน โดยเฉพาะในบริบทของการรักษามะเร็งด้วยภูมิคุ้มกันบำบัด นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารตัวอย่างในกระบวนการค้นพบยาเพื่อระบุและตรวจสอบเป้าหมายการรักษาใหม่ที่เกี่ยวข้องกับกิจกรรมของอะมิโนเปปติเดส การประยุกต์ใช้ของมันขยายไปถึงการศึกษาการอักเสบและการควบคุมภูมิคุ้มกัน ให้ข้อมูลเชิงลึกสำหรับการรักษาที่เป็นไปได้สำหรับโรคภูมิต้านตนเองและการติดเชื้อ