Antipain dihydrochloride ถูกใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมีและเซลล์ในฐานะตัวยับยั้งโปรตีเอส โดยยับยั้งโปรตีเอสเซรีนและซิสเทอีนได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้มีคุณค่าต่อการศึกษากลไกของเอนไซม์และปฏิกิริยาระหว่างโปรตีน ในการศึกษาการเพาะเลี้ยงเซลล์ มันช่วยป้องกันการย่อยสลายโปรตีน เพื่อให้มั่นใจในการวิเคราะห์กระบวนการเซลล์ที่ถูกต้อง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในขั้นตอนการชำระล้างโปรตีนเพื่อรักษาความสมบูรณ์ของโปรตีนระหว่างการสกัดและแยกต่างหาก บทบาทในการยับยั้งโปรตีเอสยังช่วยในการศึกษาอะพอพโทซิสและเส้นทางชีววิทยาที่ขึ้นกับโปรตีเอสอื่นๆ