สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาเคมีเภสัชและการพัฒนายา โดยเฉพาะในการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์ โครงสร้างของมันซึ่งมีกลุ่มเมอร์แคปโตและโมเลกุลไนโตรเบนซิล ทำให้เป็นสารกลางที่มีคุณค่าต่อการสังเคราะห์ตัวยาที่กำหนดเป้าหมาย มันมักถูกใช้ในการพัฒนาตัวยับยั้งโปรติเอส ซึ่งมีความสำคัญในการรักษาโรคเช่น HIV และตับอักเสบซี นอกจากนี้ กลุ่มไนโตรเบนซิลช่วยให้เกิดการป้องกันที่ไวต่อแสง เปิดใช้งานกลไกการปล่อยยาที่ควบคุมได้ในระบบนำส่งยา การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการวิจัยที่เกี่ยวข้องกับการศึกษาโปรติเอสซิสเทอีน ซึ่งทำหน้าที่เป็นเครื่องมือในการตรวจสอบปฏิกิริยาเอนไซม์-ซับสเตรตและเส้นทางการยับยั้ง