ตัวกลางยับยั้งโปรติเอสเป็นสารประกอบทางเคมีที่สำคัญสำหรับการสังเคราะห์ยาเภสัชกรรมที่ยับยั้งเอนไซม์โปรติเอส ตัวกลางเหล่านี้มีบทบาทสำคัญในการพัฒนาการรักษาโรคติดเชื้อไวรัสและภาวะอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการย่อยโปรตีน