แพ็กซิลลีนเป็นที่รู้จักหลักในฐานะเครื่องมือวิจัยทางวิทยาศาสตร์ โดยเฉพาะในการศึกษาช่องไอออน มันเป็นตัวยับยั้งที่แรงต่อช่องโพแทสเซียมที่ถูกกระตุ้นด้วยแคลเซียมแบบความนำสูง (BK channels) ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าต่อการตรวจสอบหน้าที่ทางสรีรวิทยาและพยาธิสรีรวิทยาของช่องเหล่านี้ นักวิจัยใช้แพ็กซิลลีนเพื่อทำความเข้าใจกลไกที่อยู่เบื้องหลังกระบวนการต่าง ๆ เช่น การหดตัวของกล้ามเนื้อ ความตื่นตัวของเซลล์ประสาท และการควบคุมโทนหลอดเลือด นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาผลกระทบของการยับยั้งช่อง BK ต่อโรคต่าง ๆ เช่น โรคลมชัก ความดันโลหิตสูง และมะเร็ง นอกเหนือจากการวิจัย แพ็กซิลลีนยังถูกศึกษาจากการเกิดขึ้นตามธรรมชาติในเชื้อราบางชนิด ซึ่งมีส่วนช่วยในการทำความเข้าใจเมแทบอลิไซต์รองของเชื้อราและผลกระทบทางชีวภาพที่เป็นไปได้