ใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่มีโครงสร้างวงแหวนพิเพอริดีนเป็นแกนหลัก กลุ่ม BOC (tert-butoxycarbonyl) ทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับไนโตรเจน ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกที่ได้เฉพาะที่ตำแหน่งอื่นของโมเลกุลในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน การมีอะตอมคลอรีนช่วยให้มีจุดปฏิกิริยาที่ใช้งานได้สำหรับการแปลงเพิ่มเติม เช่น ปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามหรือการแทนที่นิวคลีโอฟิลิก ซึ่งช่วยให้สามารถนำกลุ่มฟังก์ชันต่าง ๆ เข้ามา ใช้กันทั่วไปในการเตรียมยาสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง (CNS) รวมถึงยาแก้ปวด ยาต้านซึมเศร้า และยาต้านอาการจิตหลอน เนื่องจากอนุพันธ์พิเพอริดีนพบมากในสารประกอบที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาท คุณสมบัติความคงตัวและการทำปฏิกิริยาทำให้เหมาะสำหรับใช้ทั้งในงานวิจัยและการพัฒนายาในระดับอุตสาหกรรม