ใช้หลักๆ เป็นสารตัวกลางในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) ที่มีอนุพันธ์พิเพอราซีนเป็นส่วนประกอบโครงสร้างหลัก โครงสร้างแกนพิเพอราซีนที่ได้รับการป้องกันด้วย Boc ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกที่ตำแหน่งฟังก์ชันอื่นๆ ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอน การมีกลุ่มไนโตรเบนซิลช่วยให้สามารถแปลงโครงสร้างเพิ่มเติม เช่น การรีดิวส์เป็นอะมีนสำหรับใช้ในปฏิกิริยาคัปปลิ้ง ใช้กันทั่วไปในเคมีทางการแพทย์ในการสร้างยารักษาเป้าหมายโรคทางระบบประสาท การอักเสบ และมะเร็งบางชนิด นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมลิแกนด์ตัวรับ โดยเฉพาะที่โต้ตอบกับระบบเซโรโทนิน โดพามีน หรือฮิสตามีน เหมาะสำหรับการสังเคราะห์แบบเฟสของแข็งและเฟสละลายคล้ายเปปไทด์ เนื่องจากความเสถียรและความง่ายในการถอดกลุ่มป้องกัน Boc